第三代试管婴儿技术是指在植入胚胎/前对胚胎/进行染色体和基因筛查，以避免染色体或基因遗传病。它在第一代或第二代的基础上增加了染色体和基因筛选程序。因此，第三代试管技术也可以选择胚胎。
首先要说明一下，只有第三代试管婴儿才能通过性染色体识别技术生男生女。所谓“第三代试管婴儿技术”即“胚胎种植前遗传学诊断技术(PGD)”，指的是在胚胎植入母体前，对胚胎进行诊断和筛选，将高质量的胚胎移植进女性的子宫里，当然这个技术可以对性染色体，也就是绝对胎儿性别的基因进行筛选，想要男宝宝，就移植xy染色体的胚胎，想要女孩就移植xx染色体的胚胎。
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基因检测和染色体检测主要的区别是染色体检测可以确定染色体结构有异常，基因检测只能确定数量有无发生改变，看不到结构发生改变。换句话说，染色体检查是检查染色体数目或者是结构有没有异常的方法，一般适用于孕期检查，能够及早发现遗传性疾病，或者是预测生育有遗传疾病孩子的风险。基因检测能看到染色体上更细微的基因片段，有没有数量的改变，但是看不见结构的改变。一般基因检测，如有问题，检测机构就会把出问题的基因，去数据库对比。并告知此基因的改变，可能造成的疾病。